g6/packages/site/docs/manual/cases/edgeBundling.zh.md

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2023-02-02 10:31:36 +08:00
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title: Edge Bundling
order: 2
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## 背景
大多数图数据在可视化时被展示成点-线图Node-link Diagram的形式。点-线图特别适用于如交通网络图一类的关系数据的展示,这种数据的节点通常带有地理位置信息,例如迁徙图、移民图、航线图等。<br /> <img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*Vzp9Q7ZA0rcAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=400 alt='img'/> <img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*GRE6SrrAWnoAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=400 alt='img'/>
> (左)图 1. 法国航线图。(右)图 2. 美国航线图。
<img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*rC66Raf7OWwAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=400 alt='img'/>
<img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*AwQbT7WotYwAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=400 alt='img'/>
> (左)图 3. 世界网络 IXP 对等图。(右)图 4. 美国移民图。
## 问题
虽然点-线图提供了直观的可视化但是当数据存在大量节点和边时视觉混乱Visual Clutter很快成为严重的问题。点-线图中的视觉混乱通常是边缘拥塞的直接结果,而在如交通网络一类数据中,节点位置通常具有明确定义的含义,并不总是可以修改节点位置以减少视觉混乱,如图 1 4 四个例子。因此学术界诸多研究者设计了各种通过优化边的方式减轻上述视觉混乱其中边绑定Edge Bundling方法被广泛研究和应用。各种边绑定的方法总结在「<a href='https://yuque.antfin-inc.com/shiwu.wyy/go1ec6/znmtuw' target='_blank'>链接</a>」。
例如下面这一个复杂的美国航线数据集,节点代表美国城市,带有坐标和经纬度信息;一条边代表一条航线:
```json
{
"nodes": [
{
"x": -922.24444,
"y": 347.29444,
"id": "0",
"lon": -92.224444,
"lat": 34.729444
},
{
"x": -922.24444,
"y": 347.29444,
"id": "1",
"lon": -92.224444,
"lat": 34.729444
}
// ... 其他节点
],
"edges": [
{
"source": "0",
"target": "21",
"id": "e0"
},
{
"source": "2",
"target": "13",
"id": "e1"
}
// ... 其他边
]
}
```
如果使用 G6 简单地将节点和边渲染出来,将会得到如下结果: <br /> <img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*zYUrQqDGslMAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=850 alt='img'/>
> 图 5. G6 渲染原始数据结果
我们发现简单地将该数据渲染后的结果航线纵横交错,穿梭在密集的城市当中,视觉上十分混乱,即难以看清细节,也不能发现航线的总体趋势。
## 期待效果
我们希望可以通过边绑定的方法降低图 5 的视觉混乱,从而清晰图的整体走势、结构,突出航线频繁的城市,它们可能是重要的交通枢纽,并展示更多的统计信息,以便观察者进行分析。借助 G6我们可以实现如下效果。通过边绑定边的交错混乱情况被降低颜色映射航班的飞行方向出发橙红色与降落青色。节点大小表示到达与离开该城市的航班总数量每个节点使用了饼图展示达到橙红色和离开青色航班的比例。并增加 hover 的交互,使用 tooltip 展示每个城市的经纬度。 <br /> <img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*BC4AQbOd6HIAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=850 alt='img'/>
> 期待效果图及 tooltip 效果。
## 实现步骤
### 统计必要信息
首先,我们使用简单的 JS 根据数据统计每个节点的总度数degree即出入该城市的航线总数、出度outDegree即飞出该城市的航线数、入度inDegree即飞入该城市成航线数为后续映射到节点上做好准备。
```javascript
const nodes = data.nodes;
const edges = data.edges;
nodes.forEach((n) => {
n.y = -n.y;
n.degree = 0;
n.inDegree = 0;
n.outDegree = 0;
});
// compute the degree of each node
const nodeIdMap = new Map();
nodes.forEach((node) => {
nodeIdMap.set(node.id, node);
});
edges.forEach((e) => {
const source = nodeIdMap.get(e.source);
const target = nodeIdMap.get(e.target);
source.outDegree++;
target.inDegree++;
source.degree++;
target.degree++;
});
let maxDegree = -9999,
minDegree = 9999;
nodes.forEach((n) => {
if (maxDegree < n.degree) maxDegree = n.degree;
if (minDegree > n.degree) minDegree = n.degree;
});
const sizeRange = [1, 20];
const degreeDataRange = [minDegree, maxDegree];
// 将范围是 degreeDataRange 的 degree 属性映射到范围 sizeRange 上后,
// 写入到 nodes 中元素的 size 属性中
scaleNodeProp(nodes, 'size', 'degree', degreeDataRange, sizeRange);
```
`scaleNodeProp()` 方法将指定的节点属性 `refPropName` 根据给定数值范围 `outRange` 归一化,映射到另一个属性 `propName` 上:
```javascript
/**
* 映射属性
* @param {array} nodes 对象数组
* @param {string} propName 写入的属性名称
* @param {string} refPropName 被归一化的属性名称
* @param {array} dataRange 被归一化的属性的值范围 [min, max]
* @param {array} outRange 写入的属性的值范围 [min, max]
*/
function scaleNodeProp(nodes, propName, refPropName, dataRange, outRange) {
const outLength = outRange[1] - outRange[0];
const dataLength = dataRange[1] - dataRange[0];
nodes.forEach((n) => {
n[propName] = ((n[refPropName] - dataRange[0]) * outLength) / dataLength + outRange[0];
});
}
```
通过上面两段代码,我们已经将归一化的度数映射到节点大小 `size` 上。
### 实例化边绑定插件
G6 中提供的边绑定插件是基于 FEDB<a href='http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download?doi=10.1.1.212.7989&rep=rep1&type=pdf' target='_blank'>Force-Directed Edge Bundling for Graph Visualization</a>)一文的实现。可以通过调节参数调整边绑定的效果。
```javascript
const edgeBundling = new Bundling({
bundleThreshold: 0.6, // 绑定的容忍度。数值越低,被绑定在一起的边相似度越高,即被绑在一起的边更少。
K: 100, // 绑定的强度
});
```
### 自定义饼图节点
在第一步中,我们已经为节点大小 size 映射了每个节点的总度数。为了更详细展示每个城市飞出和飞入航班的比例,我们希望在每个节点上显示一个类似于饼图的效果。例如<img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*stNMRLlBLMUAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=60 alt='img'/> 桔红色扇形代表飞入该城市的航班比例青色代表飞出该城市的航班比例。G6 内置的 circle 、rect 等节点形状不能满足这一需求,但 G6 提供了节点的扩展机制,通过下面的代码片段,可以在 G6 中注册一个自定义的节点:
```javascript
const lightBlue = 'rgb(119, 243, 252)';
const lightOrange = 'rgb(230, 100, 64)';
// 注册自定义名为 pie-node 的节点类型
G6.registerNode(
'pie-node',
{
drawShape: (cfg, group) => {
const radius = cfg.size / 2; // 节点半径
const inPercentage = cfg.inDegree / cfg.degree; // 入度占总度数的比例
const inAngle = inPercentage * Math.PI * 2; // 入度在饼图中的夹角大小
const outAngle = Math.PI * 2 - inAngle; // 出度在饼图中的夹角大小
const inArcEnd = [radius * Math.cos(inAngle), radius * Math.sin(inAngle)]; // 入度饼图弧结束位置
let isInBigArc = 1,
isOutBigArc = 0;
if (inAngle > Math.PI) {
isInBigArc = 0;
isOutBigArc = 1;
}
// 定义代表入度的扇形形状
const fanIn = group.addShape('path', {
attrs: {
path: [
['M', radius, 0],
['A', radius, radius, 0, isInBigArc, 0, inArcEnd[0], inArcEnd[1]],
['L', 0, 0],
['B'],
],
lineWidth: 0,
fill: lightOrange,
},
// 在 G6 3.3 及之后的版本中,必须指定 name可以是任意字符串但需要在同一个自定义元素类型中保持唯一性
name: 'in-fan-shape',
});
// 定义代表出度的扇形形状
const fanOut = group.addShape('path', {
attrs: {
path: [
['M', inArcEnd[0], inArcEnd[1]],
['A', radius, radius, 0, isOutBigArc, 0, radius, 0],
['L', 0, 0],
['B'],
],
lineWidth: 0,
fill: lightBlue,
},
// 在 G6 3.3 及之后的版本中,必须指定 name可以是任意字符串但需要在同一个自定义元素类型中保持唯一性
name: 'out-fan-shape',
});
// 返回 keyshape
return fanIn;
},
},
'single-node',
);
```
这样,我们就在 G6 中注册了一个名为  pie-node 的节点类型。
### 实例化图
在这一步中,我们在实例化图时,并为之指定边绑定插件、节点类型(刚才自定义的 pie-node、节点样式、边样式渐变色
```javascript
const edgeBundling = new Bundling({
bundleThreshold: 0.6, // 绑定的容忍度。数值越低,被绑定在一起的边相似度越高,即被绑在一起的边更少。
K: 100, // 绑定的强度
});
const graph = new G6.Graph({
container: 'mountNode',
width: 1000,
height: 800,
plugins: [edgeBundling], // 加入插件
fitView: true,
defaultNode: {
size: 3,
color: 'steelblue',
fill: 'steelblue',
},
nodeStyle: {
default: {
lineWidth: 0,
fill: 'steelblue',
},
},
edgeStyle: {
default: {
lineWidth: 0.7,
strokeOpacity: 0.1, // 设置边透明度,在边聚集的部分透明度将会叠加,从而具备突出高密度区域的效果
stroke: 'l(0) 0:' + llightBlue16 + ' 1:' + llightOrange16,
},
},
});
```
这里出发端的颜色为 `llightBlue16`,结束端的颜色为 `llightOrange16`
```javascript
const llightBlue16 = '#C8FDFC';
const llightOrange16 = '#FFAA86';
```
为了配合节点和边的颜色,这里将页面的 body 的颜色设置为黑色:
```html
<style>
body {
background: rgb(0, 0, 0);
}
</style>
```
### 执行绑定和渲染
有了 graph 实例和 edgeBundling 实例后,我们执行下面代码进行绑定操作和图的数据读入及渲染:
```javascript
edgeBundling.bundling(data); // 执行插件的绑定操作
graph.data(data);
graph.render();
```
#### 设置 tooltip 与交互操作
使用 tooltip可以在鼠标 hover 到节点上时展示该节点的其他属性值。首先在 HTML 中设定 tooltip 的样式:
```html
<style>
.g6-tooltip {
border: 1px solid #e2e2e2;
border-radius: 4px;
font-size: 12px;
color: #545454;
background-color: rgba(255, 255, 255, 0.9);
padding: 10px 8px;
box-shadow: rgb(174, 174, 174) 0px 0px 10px;
}
</style>
```
然后,在上一步实例化 `graph` 时,增加一个名为 `modes` 的配置项到参数中,如下写法启动了 `drag-canvas` 画图拖动操作、`zoom-canvas` 画布放缩操作,以及 `tooltip`,在  `formatText` 函数中指定了 `tooltip` 显示的文本内容:
```javascript
modes: {
default: [ 'drag-canvas', 'zoom-canvas', {
type: 'tooltip',
formatText(model) {
const text = 'Longitude: ' + model.lon + '\n Latitude: ' + model.lat;
return text;
},
shouldUpdate: e => {
return true;
}
}]
}
```
这样,当鼠标移动到节点上时,带有经纬度信息的 `tooltip` 将会出现:<br /> <img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*d3mSS6mETf8AAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=850 alt='img'/>
> tooltip
同时,可以拖拽和放缩画布: <img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*5h5tR5eDM6UAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=550 height=350 alt='img'/>
> 缩放和拖动画布
## 分析
<img src='https://gw.alipayobjects.com/mdn/rms_f8c6a0/afts/img/A*ePUIQZaDVecAAAAAAAAAAABkARQnAQ' width=850 alt='img'/>
> 最终效果图。节点大小代表飞入及飞出该城市航线总数。节点饼图展示飞出与飞入航线比例统计信息(橙红色为飞入,青色为飞出)。边的渐变色代表航班的飞行方向。起始端:青色;结束端:橙红色。
最后,让我们一起分析如下的最终结果图给我们带来的信息:
- 大节点主要集中在中偏东部,根据其经纬度,可以推测这些城市有:亚特兰大、纽约、芝加哥、休斯顿、堪萨斯等,这些城市都是美国重要的交通枢纽;
- 美国东部的线桔红色居多,说明东部城市的飞入航班较多;
- 相反,西部城市的飞出航班较多;
- 整体飞行方向从东至西;
- 东部的航线也较之于西部更加密集、频繁;
- 西海岸由西雅图和波特兰飞往洛杉矶的航班较多。
上述发现很容易被解释:美国东部是美国的经济、政治集中区域。