--- title: Edge Bundling order: 2 --- ## 背景 大多数图数据在可视化时被展示成点-线图(Node-link Diagram)的形式。点-线图特别适用于如交通网络图一类的关系数据的展示,这种数据的节点通常带有地理位置信息,例如迁徙图、移民图、航线图等。
img img > (左)图 1. 法国航线图。(右)图 2. 美国航线图。 img img > (左)图 3. 世界网络 IXP 对等图。(右)图 4. 美国移民图。 ## 问题 虽然点-线图提供了直观的可视化,但是当数据存在大量节点和边时,视觉混乱(Visual Clutter)很快成为严重的问题。点-线图中的视觉混乱通常是边缘拥塞的直接结果,而在如交通网络一类数据中,节点位置通常具有明确定义的含义,并不总是可以修改节点位置以减少视觉混乱,如图 1 ~ 4 四个例子。因此,学术界诸多研究者设计了各种通过优化边的方式减轻上述视觉混乱,其中边绑定(Edge Bundling)方法被广泛研究和应用。各种边绑定的方法总结在「链接」。 例如下面这一个复杂的美国航线数据集,节点代表美国城市,带有坐标和经纬度信息;一条边代表一条航线: ```json { "nodes": [ { "x": -922.24444, "y": 347.29444, "id": "0", "lon": -92.224444, "lat": 34.729444 }, { "x": -922.24444, "y": 347.29444, "id": "1", "lon": -92.224444, "lat": 34.729444 } // ... 其他节点 ], "edges": [ { "source": "0", "target": "21", "id": "e0" }, { "source": "2", "target": "13", "id": "e1" } // ... 其他边 ] } ``` 如果使用 G6 简单地将节点和边渲染出来,将会得到如下结果:
img > 图 5. G6 渲染原始数据结果 我们发现简单地将该数据渲染后的结果航线纵横交错,穿梭在密集的城市当中,视觉上十分混乱,即难以看清细节,也不能发现航线的总体趋势。 ## 期待效果 我们希望可以通过边绑定的方法降低图 5 的视觉混乱,从而清晰图的整体走势、结构,突出航线频繁的城市,它们可能是重要的交通枢纽,并展示更多的统计信息,以便观察者进行分析。借助 G6,我们可以实现如下效果。通过边绑定,边的交错混乱情况被降低,颜色映射航班的飞行方向(出发(橙红色)与降落(青色))。节点大小表示到达与离开该城市的航班总数量,每个节点使用了饼图展示达到(橙红色)和离开(青色)航班的比例。并增加 hover 的交互,使用 tooltip 展示每个城市的经纬度。
img > 期待效果图及 tooltip 效果。 ## 实现步骤 ### 统计必要信息 首先,我们使用简单的 JS 根据数据统计每个节点的总度数(degree,即出入该城市的航线总数)、出度(outDegree,即飞出该城市的航线数)、入度(inDegree,即飞入该城市成航线数),为后续映射到节点上做好准备。 ```javascript const nodes = data.nodes; const edges = data.edges; nodes.forEach((n) => { n.y = -n.y; n.degree = 0; n.inDegree = 0; n.outDegree = 0; }); // compute the degree of each node const nodeIdMap = new Map(); nodes.forEach((node) => { nodeIdMap.set(node.id, node); }); edges.forEach((e) => { const source = nodeIdMap.get(e.source); const target = nodeIdMap.get(e.target); source.outDegree++; target.inDegree++; source.degree++; target.degree++; }); let maxDegree = -9999, minDegree = 9999; nodes.forEach((n) => { if (maxDegree < n.degree) maxDegree = n.degree; if (minDegree > n.degree) minDegree = n.degree; }); const sizeRange = [1, 20]; const degreeDataRange = [minDegree, maxDegree]; // 将范围是 degreeDataRange 的 degree 属性映射到范围 sizeRange 上后, // 写入到 nodes 中元素的 ‘size’ 属性中 scaleNodeProp(nodes, 'size', 'degree', degreeDataRange, sizeRange); ``` `scaleNodeProp()` 方法将指定的节点属性 `refPropName` 根据给定数值范围 `outRange` 归一化,映射到另一个属性 `propName` 上: ```javascript /** * 映射属性 * @param {array} nodes 对象数组 * @param {string} propName 写入的属性名称 * @param {string} refPropName 被归一化的属性名称 * @param {array} dataRange 被归一化的属性的值范围 [min, max] * @param {array} outRange 写入的属性的值范围 [min, max] */ function scaleNodeProp(nodes, propName, refPropName, dataRange, outRange) { const outLength = outRange[1] - outRange[0]; const dataLength = dataRange[1] - dataRange[0]; nodes.forEach((n) => { n[propName] = ((n[refPropName] - dataRange[0]) * outLength) / dataLength + outRange[0]; }); } ``` 通过上面两段代码,我们已经将归一化的度数映射到节点大小 `size` 上。 ### 实例化边绑定插件 G6 中提供的边绑定插件是基于 FEDB(Force-Directed Edge Bundling for Graph Visualization)一文的实现。可以通过调节参数调整边绑定的效果。 ```javascript const edgeBundling = new Bundling({ bundleThreshold: 0.6, // 绑定的容忍度。数值越低,被绑定在一起的边相似度越高,即被绑在一起的边更少。 K: 100, // 绑定的强度 }); ``` ### 自定义饼图节点 在第一步中,我们已经为节点大小 size 映射了每个节点的总度数。为了更详细展示每个城市飞出和飞入航班的比例,我们希望在每个节点上显示一个类似于饼图的效果。例如img ,桔红色扇形代表飞入该城市的航班比例,青色代表飞出该城市的航班比例。G6 内置的 circle 、rect 等节点形状不能满足这一需求,但 G6 提供了节点的扩展机制,通过下面的代码片段,可以在 G6 中注册一个自定义的节点: ```javascript const lightBlue = 'rgb(119, 243, 252)'; const lightOrange = 'rgb(230, 100, 64)'; // 注册自定义名为 pie-node 的节点类型 G6.registerNode( 'pie-node', { drawShape: (cfg, group) => { const radius = cfg.size / 2; // 节点半径 const inPercentage = cfg.inDegree / cfg.degree; // 入度占总度数的比例 const inAngle = inPercentage * Math.PI * 2; // 入度在饼图中的夹角大小 const outAngle = Math.PI * 2 - inAngle; // 出度在饼图中的夹角大小 const inArcEnd = [radius * Math.cos(inAngle), radius * Math.sin(inAngle)]; // 入度饼图弧结束位置 let isInBigArc = 1, isOutBigArc = 0; if (inAngle > Math.PI) { isInBigArc = 0; isOutBigArc = 1; } // 定义代表入度的扇形形状 const fanIn = group.addShape('path', { attrs: { path: [ ['M', radius, 0], ['A', radius, radius, 0, isInBigArc, 0, inArcEnd[0], inArcEnd[1]], ['L', 0, 0], ['B'], ], lineWidth: 0, fill: lightOrange, }, // 在 G6 3.3 及之后的版本中,必须指定 name,可以是任意字符串,但需要在同一个自定义元素类型中保持唯一性 name: 'in-fan-shape', }); // 定义代表出度的扇形形状 const fanOut = group.addShape('path', { attrs: { path: [ ['M', inArcEnd[0], inArcEnd[1]], ['A', radius, radius, 0, isOutBigArc, 0, radius, 0], ['L', 0, 0], ['B'], ], lineWidth: 0, fill: lightBlue, }, // 在 G6 3.3 及之后的版本中,必须指定 name,可以是任意字符串,但需要在同一个自定义元素类型中保持唯一性 name: 'out-fan-shape', }); // 返回 keyshape return fanIn; }, }, 'single-node', ); ``` 这样,我们就在 G6 中注册了一个名为  pie-node 的节点类型。 ### 实例化图 在这一步中,我们在实例化图时,并为之指定边绑定插件、节点类型(刚才自定义的 pie-node)、节点样式、边样式(渐变色)。 ```javascript const edgeBundling = new Bundling({ bundleThreshold: 0.6, // 绑定的容忍度。数值越低,被绑定在一起的边相似度越高,即被绑在一起的边更少。 K: 100, // 绑定的强度 }); const graph = new G6.Graph({ container: 'mountNode', width: 1000, height: 800, plugins: [edgeBundling], // 加入插件 fitView: true, defaultNode: { size: 3, color: 'steelblue', fill: 'steelblue', }, nodeStyle: { default: { lineWidth: 0, fill: 'steelblue', }, }, edgeStyle: { default: { lineWidth: 0.7, strokeOpacity: 0.1, // 设置边透明度,在边聚集的部分透明度将会叠加,从而具备突出高密度区域的效果 stroke: 'l(0) 0:' + llightBlue16 + ' 1:' + llightOrange16, }, }, }); ``` 这里出发端的颜色为 `llightBlue16`,结束端的颜色为 `llightOrange16`: ```javascript const llightBlue16 = '#C8FDFC'; const llightOrange16 = '#FFAA86'; ``` 为了配合节点和边的颜色,这里将页面的 body 的颜色设置为黑色: ```html ``` ### 执行绑定和渲染 有了 graph 实例和 edgeBundling 实例后,我们执行下面代码进行绑定操作和图的数据读入及渲染: ```javascript edgeBundling.bundling(data); // 执行插件的绑定操作 graph.data(data); graph.render(); ``` #### 设置 tooltip 与交互操作 使用 tooltip,可以在鼠标 hover 到节点上时展示该节点的其他属性值。首先在 HTML 中设定 tooltip 的样式: ```html ``` 然后,在上一步实例化 `graph` 时,增加一个名为 `modes` 的配置项到参数中,如下写法启动了 `drag-canvas` 画图拖动操作、`zoom-canvas` 画布放缩操作,以及 `tooltip`,在  `formatText` 函数中指定了 `tooltip` 显示的文本内容: ```javascript modes: { default: [ 'drag-canvas', 'zoom-canvas', { type: 'tooltip', formatText(model) { const text = 'Longitude: ' + model.lon + '\n Latitude: ' + model.lat; return text; }, shouldUpdate: e => { return true; } }] } ``` 这样,当鼠标移动到节点上时,带有经纬度信息的 `tooltip` 将会出现:
img > tooltip 同时,可以拖拽和放缩画布: img > 缩放和拖动画布 ## 分析 img > 最终效果图。节点大小代表飞入及飞出该城市航线总数。节点饼图展示飞出与飞入航线比例统计信息(橙红色为飞入,青色为飞出)。边的渐变色代表航班的飞行方向。起始端:青色;结束端:橙红色。 最后,让我们一起分析如下的最终结果图给我们带来的信息: - 大节点主要集中在中偏东部,根据其经纬度,可以推测这些城市有:亚特兰大、纽约、芝加哥、休斯顿、堪萨斯等,这些城市都是美国重要的交通枢纽; - 美国东部的线桔红色居多,说明东部城市的飞入航班较多; - 相反,西部城市的飞出航班较多; - 整体飞行方向从东至西; - 东部的航线也较之于西部更加密集、频繁; - 西海岸由西雅图和波特兰飞往洛杉矶的航班较多。 上述发现很容易被解释:美国东部是美国的经济、政治集中区域。